Misi FTIK antara lain:

a. Menyelenggarakan kegiatan pendidikan dan pengajaran berbasis teknologi, nilai keislaman, dan keindonesiaan

b. Melaksanakan penelitian guna mendorong upaya peningkatan mutu pendidikan Islam di Indonesia

c. Meningkatkan peran serta Fakultas dalam pengembangan pendidikan, kebudayaan dan peradaban Islam di Indonesia

d. Meningkatkan kerjasama dengan berbagai pihak dalam pelaksanaan Tri Dharma Perguruan Tinggi, terutama dalam bidang pendidikan.